1.我用Vue+webpack写完前端页面，但是我们前后端没有完全分离，要如何打包跟后台对接，然后将index.html转化为jsp文件以供后台使用。
2.打包之后会生成build文件夹，是要将build文件夹的文件提交给后台还是怎样嘛？求大神指导。
看你的描述，你应该需要这个https://github.com/laoxubuer/...
jsp是比较偏html的，不怎么关心你的js文件。
而vue+webpack的组合，出来之后html会很小，里面基本上只是共有css/js和div挂载点。关键在于js文件。
所以其实两者的配合是可以比较解耦的。
简单说，前端做出来的页面，html只放外部引用和挂载点，要求后端开发提供同样的环境就是了。
所以你只用传一个js文件过去，给一个html文件当做参考模块（或者接口）。
------我没做过jsp，就是大概知道一下。但是jsp让后端去写就好，你只管那个js文件。
不知道你说的 前后端没有完全分离 指的是哪部分，如果模版数据耦合就麻烦了，仅仅是页面耦合比较好办。
如果用的是尤雨溪大大默认的 webpack 配置，build 下应该会生成 js 等文件，以及 index.html。我的建议是，index.html 交后端，其他文件由你单独发布，比如到一个 CDN，这样你们与后端的工作并行，以后开发起来也会灵活一点。
对你们的业务不了解，只是猜想哈，如果有问题再交流。
初学 Vue， 建议使用 YYX 大大的 vue-cli 生成一个项目模板，然后基于这个模板开发可以避免许多困惑（包括打包之类的）。