请问有业内人士告知吗？
一直弄不清楚期间发生了什么事。
nodejs和iojs合并之前，iojs是3.x版本，加之iojs中用到的各种底层库都是更新的，所以合并之后，版本号用4.0
和iojs合并了，防止版本混乱，用了iojs的版本号。
既然你不知为什么，知道了也对你没用。。
大致是Node.js的一批开发者不满Joyent掌控下太过保守的开发进度，于是fork出了io.js。
然后io.js版本演进比较快，很快就1.0、2.0、3.0版本号暴增。
于此同时Joyent采取了很多手段与开发者进行沟通，重新组织了Node.js的开发管理方式，得到了更普遍的认同之后，决定之后重新将iojs和node.js代码合并，版本同步起来。为了避免和已经有1.0-3.0的io.js混淆，之后的版本号直接跳到4.0开始。
大致差不多是这个意思，具体的时间点和商讨出的开发模式可以自己搜索一下，有相关的文章介绍。
应该是从Node.js 4.0开始就没有io.js和node.js的分别了。
请学会使用搜索引擎。