比如商品表和属性表，因为是多对多的关系，所以有个商品属性中间表；
CREATE TABLE IF NOT EXISTS dslxs_goods_attr (goods_id mediumint(8) unsigned NOT NULL COMMENT '商品的id',attr_id mediumint(8) unsigned NOT NULL COMMENT '属性的id',
KEY goods_id (goods_id),
KEY attr_id (attr_id)
) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=utf8 COMMENT='商品属性中间表';
如果在这张表中加个id mediumint(8) unsigned NOT NULL AUTO_INCREMENT,并设为主键PRIMARY KEY (id)。这样会不会快点，没有大数据测试不起来，哪位经验多的请告知一下。。
所谓的KEY只是索引的别名而已，而索引才是提升你这种映射表查询速度的关键，而你已经设置了这两个字段的索引了。现在可能要做的就是加个外键，提升表和整个数据库的稳定性，其他的也就这样了，加唯一键反而会略微增加插入负担，而且肯定不会有基于这个唯一键的查询，也许存在基于这个键的删除（可能性很小，非要加速的话，就添加一个二者的联合索引，插入会变慢，索引文件会变大）。
大致就是这样，要跳出所有表都要来个唯一递增键的误区。
补充一点，希望有些帮助。
聚簇索引：
MySQL InnoDB一定会建立聚簇索引，把实际数据行和相关的键值保存在一块，这也决定了一个表只能有一个聚簇索引，即MySQL不会一次把数据行保存在二个地方。
1) InnoDB通常根据主键值(primary key)进行聚簇
2) 如果没有创建主键，则会用一个唯一且不为空的索引列做为主键，成为此表的聚簇索引
3) 上面二个条件都不满足，InnoDB会自己创建一个虚拟的聚集索引
优点：
聚簇索引的优点,就是提高数据访问性能。聚簇索引把索引和数据都保存到同一棵B+树数据结构中，并且同时将索引列与相关数据行保存在一起。这意味着，当你访问同一数据页不同行记录时，已经把页加载到了Buffer中，再次访问的时候，会在内存中完成访问，不必访问磁盘。不同于MyISAM引擎，它将索引和数据没有放在一块，放在不同的物理文件中，索引文件是缓存在key_buffer中，索引对应的是磁盘位置，不得不通过磁盘位置访问磁盘数据。
缺点：
1) 维护索引很昂贵，特别是插入新行或者主键被更新导至要分页(page split)的时候。建议在大量插入新行后，选在负载较低的时间段，通过OPTIMIZE TABLE优化表，因为必须被移动的行数据可能造成碎片。使用独享表空间可以弱化碎片
2) 表因为使用UUId作为主键，使数据存储稀疏，这就会出现聚簇索引有可能有比全表扫面更慢，所以建议使用int的auto_increment作为主键
3) 如果主键比较大的话，那辅助索引将会变的更大，因为辅助索引的叶子存储的是主键值；过长的主键值，会导致非叶子节点占用占用更多的物理空间
引自：http://blog.csdn.net/wyzxg/article/details/8779235