之前使用版本5.1.30，如下，
Welcome to the MySQL monitor. Commands end with ; or \g.
Your MySQL connection id is 411566
Server version: 5.1.30-log Source distribution有个致命的问题：主从备份无法设定备份时间，只能实时
根据评论更新选择：
5.1.30： 不选择，没有定时备份功能，就是主从的时候，必须实时的。想定时不行
5.5.18： 理由：稳定，各个大牛公司都在用，所以我也用
我们公司用的是5.6的
MySQL官方最新的5.5或5.6版本。Linux上第三方可以试试Percona Server。
淘宝以前用原版Oracle，
中期业务拓展开始自定义Mysql，做超大型数据集群。
现在用自主研发OceanBase了，双十一淘宝没有炸锅就是靠这玩意儿顶住的。
淘宝是随着业务不断庞大，逐步在更替自己的数据库，更换过程相当痛苦与漫长。
至于你们公司使用什么版本，其实只需要你们项目创建初期，去mysql官网下载一个当前稳定版本，即可。
在数据库达到瓶颈之前，在项目运营期间是不推荐频繁切换数据库版本的。
dev.mysql.com 使用5.5
引用一下别人的回答：
数据库还是不要随便升级。你使用这个稳定比较好的话。就不要升级不要给自己找麻烦事情做的。我们现在还在用5.0.37 google 补丁版。如果真的想没事找点事情做的话，就推荐facebook现在使用5.1.53,还有就是twitter使用版本mysql5.5,taobao mysql 5.5.18.
原地址：http://www.oschina.net/question/147332_108175