我是几年前写着struts一路走来的，后来开始用php，喜欢php的简单。
随着项目参与人员的增长，必须要有规范，要有流程，所以开始研究了一些框架，自己也封装了简单的router,mvc部分。
最近在看另一个php的框架的时候，突然感觉有点疑惑。
在类似java这种应用程序中，我们封装的框架部分可以一直持久在内存中，不必每次加载。但是php的机制是一次请求一次加载。那么每一个请求，都要处理加载配置文件，加载一堆封装的东西是不是有点太浪费了。
那是不是php也会把一些东西放在内存呢？对于这一块请大牛给解释解释。
opcode是一种思路，accelerate之类的也还可以。只是听大牛的分享里面讲过。http://www.infoq.com/cn/presentations/php-project-control
php有类似java字节码的opcode cache机制，server中运行的php文件会以编译后的opcode的形式缓存在内存中
常见的opcode cache参考 维基：PHP加速器列表
5.5后PHP官方内置了Zend Optimizer。
所以顺便建议配置文件、模版等都以php格式存在，以最大化利用opcode cache，减少磁盘IO
可以把一些固定的配置项写到apache的环境变量里面，php里面用 $_ENV来读取。apache每fork出一个进程，就会带上这些配置，而且是常驻内存的。
PHP 本身是不会常驻缓存的，一个请求结束，PHP也就停止执行了。这正是PHP的特点，无须考虑内存、并发等等等东西。
不过你所说的
“那么每一个请求，都要处理加载配置文件，加载一堆封装的东西是不是有点太浪费了。”
并不完全准确。主流的PHP框架都是有缓存的，缓存机制避免了这个问题。
PS：看到没人回答，估计是被楼主写的 “对于这一块请大牛给解释解释。” 吓跑了，我不是大牛，普通 PHP 程序员一名，特此声明。
apc、 zend optimizer plus、也就是 php 5.5 起的 opcache 。
都是预编译文件并把 opcode 缓存在内存中， 这是解决你困惑的常规方法， 建议适当使用， 可以给 php 提速 20 到 300 个百分点。
但对于无论 php 还是 java， 瓶颈其实都在数据库 io 上， 把文件加载、配置步骤省去之后，一般提速都不会太多 20 到 100 个百分点， 尤其是数据库操作频繁的。
讲的主要针对的是你提问，其他不相关的就不涉猎。
首先不得不吐槽下，php在这方面真的“很弱”，“很弱”并不代表php真很恨“差劲”，不可否认，php是最好的动态模版语言。
php是动态的解释型语言，在语言这个角度提供的功能非常有限，大概这也就是为什么都感觉php上手非常容易的原因吧。于是我们摸索／探索，总结出了很多优秀的框架(Yii, Zend Framework...)，集合了很多牛逼的的技术（缓存／队列／集群／复制集／异步/配置系统／日志系统／监控系统／自动化...)到了这个层面也就是出现了楼主的疑惑（php框架的一些疑惑），首先要恭喜你，你最少到了php开发的中级水平，好多人都不敢尝试。这种疑惑是正常反应。因为理解的多了，你就会想整个过程，如果每次请求处理都这样，确实有点效率底下，php在代码层次（PHP5统称OP+)提供了加速器／缓存器，据说可以提高30%＋以上的性能，用过的可以pass过。其实早在几年前laruence就反思过这个问题，并开发出了Yaf（框架在php启动的时候已经驻留在内存中了）,这里我就不多讲Yaf,有兴趣你可以去看下。