/etc/php5/fpm/php.ini 配置文件里面没看到设置extension_dir ，但是扩展加载成功可以使用，我用的ubuntu，每个扩展都有一个配置(example:pdo.ini mysqli.ini) ,这些文件是怎么加载的?
在php编译时添加一些指定的参数来达到加载附加ini文件的目的：
--with-config-file-path=PATH
Set the path in which to look for php.ini [PREFIX/lib] 这个是指定php.ini的位置
--with-config-file-scan-dir=PATH
Set the path where to scan for configuration files 这个是指定附加的ini配置文件的目录位置，此目录下的ini文件会被追加到php.ini配置中
http://php.net/manual/zh/function.php-ini-scanned-files.php