然后再刷新一下就不闪烁了？ example: 一个示例
环境是 win7 + chrome34...
我也遇到过，不只是bootstrap固定顶部导航栏会闪烁，只要是在css中使用了position:fixed;top:0;固定吸顶的元素，使用鼠标滚轮滚动页面时都会有这种闪烁（渲染速度跟不上）的问题。
这是chrome浏览器的内部机制导致的，楼主使用鼠标点住scrollbar拖动页面试试，就不会有这种情况了。
其实并不影响使用，待后续版本的chrome修复这个问题吧。
@林粽子 在新浪微博里评论说“不排除硬件的可能”，有参考价值。